Program D2000 CfgSynchro umožňuje aj kopírovanie tzv. doplnkovej konfigurácie, ktorá nie je priamo zviazaná s objektami systému D2000. Ide o konfiguráciu:
Tieto časti konfigurácie sa buď nesynchronizujú vôbec alebo sa synchronizujú úplne (v cieľovej konfiguračnej databáze budú existujúce časti zmazané).